Axiom™ 苹果基因分型阵列 (Axiom JKI50kMd),迷你96规格

Applied Biosystems Axiom 苹果基因分型阵列是我们 Axiom 农业基因组学基因分型解决方案的组成部分,其所含的靶标基因组 DNA 均在 GeneTitan 多通道仪器上制备和处理。该自动化过程包括将 gDNA 与该高通量微阵列杂交,然后进行染色、洗涤、成像和输出基因分型数据以供进一步分析。

Axiom 苹果基因分型阵列有48,139个苹果属 SNP。该阵列是与 Julius Kühn 研究所的 Peil 博士和其他国际合作伙伴合作设计的。该阵列使用一个先前进行基因分型的不同品种组合以及一个野生苹果属种质组合进行设计。

该阵列的设计包括以下内容：
• 向后兼容的一组 SNP（7,711个）,这些 SNP 可在 Illumina Infinium 20K 阵列和 Applied Biosystems Axiom 480K 阵列上准确、可靠地聚类
• 采用单倍型块策略使每 125 kB 中一个 10 kB 窗口包含8个 SNP,均匀覆盖 HFTH1 全基因组序列
• 针对重要性状的经验证 SNP
• 专门针对苹果属山荆子、西府海棠、东方荚果蕨、八枝海棠、新疆野苹果和欧洲野生苹果的 SNP
• 用于检测 S 等位基因的一组 SNP

该阵列还具有 384HT 规格。

所需产品
GeneChip Commａnd Console 软件
GeneTitan 多通道仪器
Axiom Analysis Suite 软件
Axiom 长格式导出工具 (AxLE)